2018年，崇明区完成农业总产值58.8亿元，比上年增长2.6%。其中，种植业产值28.4亿元，增长4.5%；林业产值6.7亿元，增长20.8%；畜牧业产值8.4亿元，下降11.8%；渔业产值12.3亿元，下降4.4%；农业服务业产值3亿元，增长37.3%。

　　2019年11月18日，崇明区入选“农业绿色发展先行先试支撑体系建设试点县”。

　　2020年1月2日，崇明区入选全国第四批率先基本实现主要农作物生产全程机械化示范县（市、区）名单。